FluroBreaker
Quand la biologie de synthèse défie les polluants éternels

Notre projet

Imaginez un monde où l'eau, l'air et les sols sont débarrassés des PFAS, ces "polluants éternels" qui détruisent notre santé. C'est le défi à la Erin Brockovich que nous voulons relever ! L’iGEM Lyon 2025 réunit une équipe de 19 étudiants de l’INSA, de l’ENS et de l’Université Lyon 1, participant à iGEM, le plus grand concours international de biologie de synthèse. 

Notre mission : détecter et dégrader les PFAS grâce à la biologie de synthèse. Ces polluants ultrarésistants s'accumulent particulièrement à Lyon, où les concentrations atteignent des niveaux préoccupants.

Notre approche

La première phase a consisté en une étude de la littérature à ce sujet, pour identifier des bactéries et enzymes capables de dégrader les PFAS, tout en approfondissant la compréhension des réactions enzymatiques impliquées.

Actuellement, notre équipe se concentre sur l'optimisation des enzymes naturellement capable de dégrader le fluor, en utilisant des outils de docking moléculaire et de protein design. L'objectif est d'identifier les mutations les plus prometteuses pour améliorer l’activité de ces enzymes. Cette approche par informatique permet de limiter le nombre d'expériences en laboratoire en ciblant une vingtaine de mutations, plutôt qu'une centaine.

En parallèle de la dégradation, une bactérie capable de détecter la présence des PFAS et d’émettre un signal lumineux en réponse sera développée (on parle de biosenseur bactérien). 

Dans un second temps, une analyse transcriptomique par RNA-seq sera réalisée afin d’identifier les gènes dont l’expression est augmentée en présence de PFAS. Cette stratégie permettra de sélectionner

les biomarqueurs les plus pertinents pour concevoir un biosenseur bactérien sensible et spécifique. Enfin, ces gènes seront introduits dans le code génétique (ADN) d’une bactérie, qui sera capable d’émettre une fluorescence proportionnelle à la concentration en polluant (PFAS).